У процесі такого проживання відбувається метаморфоз, і поліп поступово ділиться. Більша його частина переходить до життя у воді, а залишився на дні шматок гине.
Для розмноження кубомедузи необхідні самець і самка, тобто запліднення відбувається статевим шляхом. Найчастіше зовнішньо. Але деякі види воліють надходити по-іншому. Наприклад, самці Carybdea sivickisi виробляють сперматофори (ємності зі сперматозоїдами) і віддають їх самкам.
Самки ж зберігають їх у своїй кишкової порожнини до тих пір, поки вони не знадобляться для запліднення. Самочки виду Carybdea rastoni самі знаходять і підбирають виділену самцями сперму, яку запліднюють яйця.
З яєць утворюється ресничная личинка, яка осідає на дні і перетворюється в поліпа. Вона називається планула. З приводу розмноження і життєвого циклу так само ходять суперечки. З одного боку, «народження» з одного поліпа тільки однієї медузи трактується як метаморфоз.
З чого випливає, що поліп і медуза це дві стадії онтогенезу одного істоти. Ще один варіант-це формування медузи у процесі форми розмноження, яку вчені називають монодисковой стробиляцией. Вона аналогічна полидисковой стробиляции поліпів при походженні сцифоидных медуз.
Природа кубомедузи передбачає дуже давнє походження. Найдавніші викопні останки знайдені поблизу міста Чикаго і оцінені вченими в вік більше 300 мільйонів років. Ймовірно, їх смертельна зброя було покликане захистити цих тендітних істот від гігантських мешканців глибин тієї епохи.